Samosprávu fakulty vykonávají členové akademické obce fakulty přímo nebo prostřednictvím samosprávných akademických orgánů. Samosprávnými akademickými orgány fakulty jsou Akademický senát, Děkan, Vědecká rada fakulty a Disciplinární komise fakulty. Dalšími orgány jsou Kolegium děkana a Krizový štáb.